Jonathan LaPaglia est le frère d'Anthony Lapaglia (FBI Portés disparus). Il joue dans la série NCIS Enquêtes spéciales diffusée depuis 2003 sur CBS et l'année suivante sur M6.
Jonathan LaPaglia fait ses débuts d'acteur au milieu des années 90 dans la série New York Undercover avant d'intégrer une autre série l'année suivante, Sept jour pour agir où il a le rôle principal mais après trois saisons, le programme s'arrête mais il n'en faut pas plus pour le décourager.
Il "grossit" le casting d'une nouvelle série, Washington Police dans la foulée et reste trois saisons (de la 2 à la 5) avant de faire de nombreuses apparitions dans la série Windfall mais surtout d'intégrer l'équipe de la série NCIS Enquêtes spéciales avec Mark Harmon pour trois épisodes, mais il la retrouve en tant que récurent dans la saison 6.